Generowanie i przedkładanie w urzędach skarbowych plików JPK znacząco uprości i przyspieszy przeprowadzanie kontroli czy czynności sprawdzających u podatników (w zakresie prowadzonej przez nich sprzedaży). Nie będzie już konieczne, aby urzędnicy wertowali i analizowali wszystkie dokumenty. Trzeba pamiętać, że regulacja ta będzie dotyczyć wyłącznie dokumentów wystawianych po 1 lipca 2018 roku. Zatem pierwsze żądanie o przedstawienie nowych struktur JPK (np. dotyczących faktur sprzedażowych) będzie mogło pojawić się dopiero po 25 sierpnia.

Przedstawiciele Ministerstwa Finansów uspokajają podatników, że nie będą musieli kupować nowych programów do fakturowania, które umożliwią generowanie plików JPK. Resort pracuje nad rozbudowaniem aplikacji e-mikrofirma, z której już można korzystać w zakresie przygotowywania JPK VAT. Bezpłatnie będzie można za jej pomocą wystawiać i przesyłać faktury oraz tworzyć struktury jednolitych plików kontrolnych dla faktur. Rozszerzoną funkcjonalność aplikacji będzie można sprawdzić w lipcu. Zapewne z tego rozwiązania będą korzystać jednak wyłącznie najmniejsi przedsiębiorcy, ponieważ jego stosowanie będzie wymagało ręcznego wprowadzenia do niego faktury. Dla przedsiębiorców, którzy wystawiają dużą liczbę faktur, korzystniejsze będzie zaktualizowanie swojego oprogramowania.

Od 1 lipca 2018 roku, na żądanie organów, podatnicy prowadzący księgi podatkowe elektronicznie będą musieli generować następujące struktury JPK
(w zależności od prowadzonej ewidencji księgowej):

• księgi rachunkowe – JPK_KR,
• podatkowa księga przychodów i rozchodów – JPK_PKPIR,
• ewidencja przychodów – JPK_EWP,

a niezależnie od prowadzonej ewidencji:

• wyciąg bankowy – JPK_WB,
• magazyn – JPK_MAG,
• faktury VAT – JPK_FA.